Thesis Number |
level |
Language |
Year |
Bilim Dalı |
|
Yüksek Lisans |
Türkçe |
2017 |
Diğer |
Filogruplandırma, E. coli suşlarının karakteristik özelliklerinin anlaşılması,
enfeksiyonların önlenmesi, kontrol edilmesi ve yeni tedavi yöntemlerinin
belirlenmesinde önemli rol oynamaktadır.
Bu çalışmada kanatlı kökenli E. coli (APEC ve AFEC) suşlarının
filogruplandırılması amaçlandı. Çalışmada identifiye edilen 150 adet APEC ve 150
adet AFEC suşunun filogruplandırılması kuadrupleks PCR (Clermont ve ark., 2013)
metodu ile araştırıldı. Filogruplandırma sonucu incelenen 150 adet APEC suşunun 4'u
A (% 2,66), 43'ü B1 (% 28,66), 38'i B2 (% 25,33), 2'si C (% 1,33), 18'i E (% 12), 5'i
F (% 3,33), 1'i Clade I (% 0,66), 2'si negatif (% 1,33) olarak gruplandırıldı ve
gruplandırılmayan 37 (% 24,66) suş tespit edildi. İncelenen 150 adet AFEC suşunun
5'i A (% 3,33), 8'i B1 (% 5,33), 16'si B2 (% 10,66), 16'si C (% 10,66), 1'i D (% 0,66),
27'si E (% 18), 9'u F (% 6), 3'ü Clade I veya Clade II (% 2) olarak gruplandırıldı ve
gruplandırılmayan 51 (% 34) suş tespit edildi.
Escherichia coli enfeksiyonlarının önlenmesi amacıyla geliştirilecek olan
aşılarda mutlaka yersel suşların kullanılması ve bu suşlara ait özelliklerin belirlenmesi
gerektiği anlaşıldı. Bununla birlikte genotipik olarak çok çeşitlilik gösteren E. coli
suşlarının, özellikle APEC suşlarının, daha detaylı genotipik analizler yapılarak yeni
filogrupların araştırılması gerektiği düşünüldü.